از مهمترین اهداف فیزیوتراپی در جراحی ها، جلوگیری از عوارض پس از عمل و بستری شدن و همچنین برگشت سریع تر بیمار به فعالیت های روزمره است. بعضی از مواردی که پس از عمل جراحی نیاز به فیزیوتراپی دارند شامل:
*آرتروپلاستی (تعویض مفصل)
*جراحی های ترمیمی اعصاب محیطی
*جراحی های قفسه سینه و ریه
*جراحی های ترمیمی تاندون ها
*جراحی به دنبال شکستگی ها و دررفتگی ها
*جراحی به علت تومورهای سیستم عصبی
*آمپوتاسیون (قطع عضو)
*جراحی های نواحی فک و صورت
*جراحی های قلب و عروق